En Honduras, la SESAL (Secretaría de Salud) es la entidad encargada de coordinar y organizar el sector salud. SINAGER se constituye en un colaborador importante en el manejo de las epidemias, y coordina a todas las Instituciones del Estado, de la empresa privada y las organizaciones de la sociedad civil del país (artículo 2 y 3 Ley del SINAGER) en la respuesta a desastres provocados por fenómenos naturales o humanos, sin embargo, quien coordina es la SESAL.
En una comparecencia a medios el 16 de marzo, el Poder Ejecutivo justificó la aprobación presupuestaria y Ley Especial de Aceleración Económica y Protección Social Frente a los Efectos del Coronavirus unos días antes expresando que iba a desarrollar varias iniciativas para responder a la situación sanitaria. Afirmó que esto incluía la construcción de más de 90 hospitales de diferentes tamaños per ser parte de la Red Pública de Servicios de Salud que, “van desde unidades básicas de atención de salud hasta 11 hospitales”.